Introdução a genômica, estimadores de recombinação e mapeamento genético (16/11/2020 - 20/11/2020)

Introdução ao mapeamento, genética mendeliana e leis de segregação. Informações gerais sobre mapeamento em populações segregantes. Genética mendeliana. Ligação genética, permutação e recombinação. Estudos de ligação fatorial em populações segregantes e ordenamento de genes. Tipos de mapeamento, populações de mapeamento e funções de mapeamento.

  

Genotipagem por sequenciamento

  
  

Recombinação

  
      
Inicia em 16/11/2020 às 0h 0 e finaliza em 18/11/2020 às 23h 59
  

Marcadores moleculares

  
      
Inicia em 16/11/2020 às 0h 0 e finaliza em 18/11/2020 às 23h 59
   Aula 1 pdf   
Aula prática e revisão do conteúdo (18/11/2020 - 20/11/2020)

Revisão do conteúdo Aula prática - softwares para mapeamento

  onemap manual   
  

Tutorial joinmap video mudo

  
      
Inicia em 19/11/2020 às 0h 0 e finaliza em 23/11/2020 às 11h 59
  Frishman et al 2001   
Artigo complementar a atividade 3
      
Inicia em 19/11/2020 às 21h 0 e finaliza em 20/11/2020 às 23h 59
  Rotina Mimulus   
Rotina R para o mapeamentos da pulação F2 do cruzamento entre as linhagens endogâmicas puras IM62 (Mimulus guttatus) e SF5.4 (Mimulus nasutus)
Introdução a análise de QTLs (24/11/2020 - 24/11/2020)
Introduação a análise de QTLs. Média e Variância genotípica. Componentes de variância genotípica.
      
Inicia em 24/11/2020 às 12h 0 e finaliza em 26/11/2020 às 12h 59
Mapeamento de QTLs (24/11/2020 - 26/11/2020)

Mapeamento de QTLs por marcas simples 

Mapeamento de QTLs por intervalo composto 

Mapeamento de QTLs - regressão multipla

      
Inicia em 27/11/2020 às 0h 0 e finaliza em 28/11/2020 às 23h 59
Mapeamento de QTLs por intervalo composto (25/11/2020 - 25/11/2020)

Aplicação de regressão múltipla no mapeamento de QTLs. Mapeamento por intervalo composto. Teste de hipótese e significância para análise de QTL. Lista de exercícios 4.
Mapeamento de QTLs - regressão multipla (25/11/2020 - 25/11/2020)

Aplicação de regressão múltipla no mapeamento de QTLs. Teste de hipótese e significância para análise de QTL. Lista de exercícios 4.
Aula Prática - Uso de softwares para o mapeamento de QTL (26/11/2020 - 27/11/2020)

Uso de softwares para o mapeamento (JoinMap5.0, MapDisto, WinQTLcart 2.5, utilização do genoma de referência, identificação de modelos gênicos candidatos (NCBI e Phytozome 12). Entrega das listas de exercícios 1, 2, 3 e 4.

  

WinQTL

  

Esse é um tutorial basico do software WinQTLCart.

      
Inicia em 26/11/2020 às 0h 0 e finaliza em 29/11/2020 às 18h 59

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